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Die Entdeckung von Krebsmedikamenten wird durch eine große 3D-Datenbank unterstützt
Die Erweiterung der weltweit größten Datenbank für Krebsforschung und Wirkstoffforschung um 3D-Verbesserungen dürfte Forschern, die nach effektiveren Wegen zur Entwicklung neuer Krebstherapien suchen, einen enormen Schub geben.
Die Datenbank enthält nun die 3D-Strukturen von fast 3 Millionen Nischen auf der Oberfläche von fast 110.000 krebserregenden Molekülen.
So schließen Forscher, die wichtige Aktualisierungen zu canSAR abgeschlossen haben, eine große, öffentlich verfügbare Krebsdatenbank, die auf Wissen aus Bereichen wie Biologie, Chemie, Pharmakologie und Strukturbiologie basiert, um die Interpretation experimenteller Daten zu unterstützen und Vorhersagen für die Wirkstoffforschung zu ermöglichen.
Das Team vom Institut für Krebsforschung (ICR) in London, Großbritannien, beschreibt die neuen Erweiterungen von canSAR in der Zeitschrift Nukleinsäurenforschung.
Ein wesentliches Merkmal des Updates ist das Hinzufügen von 3D-Strukturen fehlerhafter Proteine ??und Karten von Krebs-Kommunikationsnetzwerken.
Weitere Verbesserungen sind bessere Such- und Browsing-Tools, neue Zusammenfassungen von Krankheitsbildern und Krebslinien sowie verbesserte Werkzeuge zur Chargenanalyse, wie die Autoren des von Cancer Research UK finanzierten Projekts feststellen.
Der leitende Autor Dr. Bissan Al-Lazikani, der die Entwicklung von canSAR geleitet hat und dessen Forschung am ICR sich auf die Entwicklung und Anwendung multidisziplinärer Computertechniken zur Unterstützung der Wirkstoffforschung konzentriert, sagt:
"Unser Ziel ist es, dass Krebswissenschaftler mit den Daten versorgt werden, die sie benötigen, um lebensrettende Forschung zu den aufregendsten Medikamenten der Zukunft durchzuführen."
Die canSAR-Datenbank läuft seit 2011 und zielt darauf ab, mit "Big Data" ein detailliertes Bild davon zu erstellen, wie sich die meisten menschlichen Moleküle verhalten.
Die Datenbank enthält bereits Milliarden von experimentellen Messungen, die den Effekt von einer Million Drogen und Chemikalien auf menschliche Proteine ??abbilden. Sie hat diese Informationen auch mit genetischen Daten und Ergebnissen aus klinischen Studien verknüpft.
Dr. Al-Lazikani erklärt, warum die Ressource so nützlich ist:
"Wissenschaftler müssen alle Informationen über ein fehlerhaftes Gen oder Protein finden, um zu verstehen, ob ein neues Medikament funktioniert. Diese Daten sind riesig und verstreut, aber die canSAR-Datenbank bringt sie zusammen und schafft Mehrwert, indem sie versteckte Links identifiziert und den Schlüssel präsentiert Informationen leicht. "
Größte Datenbank zur Entdeckung von Krebsmedikamenten weltweit
Das neueste Update bedeutet, dass Forscher - mithilfe künstlicher Intelligenz - nach nützlichen Nischen auf der Oberfläche von fehlerhaften krebserzeugenden Molekülen suchen können, die von neuen Medikamenten verwendet werden könnten, um ihre Wirkung zu blockieren.
Die Datenbank enthält nun die 3D-Strukturen von fast 3 Millionen Nischen auf der Oberfläche von fast 110.000 krebserregenden Molekülen.
Ein weiteres neues Merkmal ist, dass Wissenschaftler Kommunikationswege identifizieren können, um Tumorzellen zu blockieren.
Laut Dr. Al-Lazikani ist die Datenbank mit über 140.000 Nutzern aus über 175 Ländern die größte ihrer Art in der Welt.
Sie und ihr Team ergänzen das ständig und "entwickeln regelmäßig neue Technologien für künstliche Intelligenz, die Wissenschaftlern dabei helfen, Vorhersagen zu treffen und Experimente zu planen", fügt sie hinzu.
Dr. Kat Arney, wissenschaftliche Informationsmanagerin bei Cancer Research UK, sagt, dass alles, was Zeit und Kosten bei der Suche nach neuen Krebsbehandlungen spart, dazu beitragen wird, die nächste Generation von Medikamenten noch früher zu Patienten zu bringen, und stellt fest:
"Diese Datenbank stellt Wissenschaftlern auf der ganzen Welt Massen von detaillierten wissenschaftlichen Informationen über Krebs zur Verfügung und wird wichtige Fortschritte bei der Wirkstoffforschung beschleunigen - und letztlich mehr Leben retten."
Die canSAR-Datenbank ist online über das ICR verfügbar.
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