Matching-Patienten mit Biomarker-Driven Cancer Trials - genetische Sequenzierung könnte helfen

Krebsforscher entwickeln einen Katalog potenzieller Angriffspunkte für neuartige Therapien, während sie weiterhin genetische Mutationen identifizieren, die verschiedene Krebs-Subtypen antreiben.
Kürzlich schlossen das Comprehensive Cancer Center der University of Michigan und das Michigan Center for Translational Pathology (MCTP) eine Pilotuntersuchung ab. Ziel der Studie war es, die praktischen Herausforderungen zu lösen, die Forscher bei der schnellen und systematischen Sequenzierung von genetischem Material von Patienten mit fortgeschrittenem oder therapieresistentem Krebs haben, damit sie mit den vorhandenen klinischen Studien auf der Grundlage der identifizierten Biomarker abgestimmt werden können. Die Ergebnisse der explorativen Untersuchung, die als Michigan Oncology Sequencing Projekt (MI-ONCOSEQ) bekannt sind, sind in veröffentlicht Wissenschaft Translationale Medizin.
Co-leitender Forscher Dr. Dan Robinson, Postdoktorand am MCTP, erklärt:

"Wir reden über mehr als nur einige Gene zu untersuchen, bei denen bekannt ist, dass Mutationen auftreten, oder sogar über hundert Gene. Wir sprechen von der Fähigkeit, mehr als 20.000 Gene zu sequenzieren und nicht nur nach einzelnen genetischen Mutationen zu suchen bei Kombinationen von Mutationen. "

Die Forscher entdeckten, dass die Identifizierung der "Mutationslandschaft" einer Person eine vielversprechende Technik darstellt, um zu bestimmen, welche Studien einem Patienten am besten helfen könnten.
Dr. Sameek Roychowdhury, klinischer Dozent für Hämatologie und Onkologie an der U-M Medical School, sagt:

"Die Hochdurchsatz-Sequenzierung nutzt die neuesten technologischen Fortschritte, um Millionen von genetischen Informationen zu verarbeiten und so die genetischen Aberrationen eines Krebses zu kartieren. Die Verwendung dieser Technik zur Identifizierung von Biomarker-gesteuerten Behandlungsoptionen öffnet die Tür für personalisierte Onkologie eine Reihe von logistischen Herausforderungen, von denen die meisten die Ergebnisse kostengünstig und in einem klinisch relevanten Zeitrahmen verfügbar machen.
Vor ein oder zwei Jahrzehnten hätte diese Art der Sequenzierung viele Millionen oder sogar Milliarden von Dollar gekostet, aber die Technologie schreitet so schnell voran, wir sprechen jetzt von Tausenden - was die weit verbreitete Nutzung zu einer echten Möglichkeit macht. "

Krebs kann aus einer Reihe von genetischen Veränderungen stammen, einschließlich Hinzufügungen, Deletionen, Umordnungen und Substitutionen innerhalb des genetischen Codes.
Roychowdhury, sagt:

"Verschiedene Sequenzierungsverfahren sind erforderlich, um verschiedene Arten von Veränderungen zu finden. Um kosteneffizient zu sein, muss es jedoch einen Balanceakt zwischen einer umfassenden Analyse und einer tiefen Analyse geben."

Die Forscher untersuchten zunächst den Sequenzierungsansatz der Forscher bei Prostatakrebstumoren, die in Mäusen gezüchtet worden waren. Später wurden in der Studie zwei Personen in einen klinischen Pilotversuch aufgenommen: ein Patient mit Kolorektalkarzinom und einer mit Melanom. Für beide Teilnehmer wurden mögliche klinische Studien identifiziert.
Die Ermittler warnen jedoch, nicht alle Individuen werden einer bestehenden Studie entsprechen. Einige mit einer bestimmten Mutation könnten ausgeschlossen werden, da sie zum Beispiel Prostatakrebs haben, aber eine Studie erfasst nur Personen mit Brustkrebs. Den Forschern zufolge bietet diese Methode auch die Möglichkeit, klinische Studien auf eine neue Art und Weise anzugehen, indem sie von einem gewebespezifischen Fokus zu genetischen Aberrationen übergehen, die auf verschiedene Krebsarten verteilt sind.
Sie warnen davor, dass die Teilnahme an einer Studie nicht garantiert, dass die Person von der Behandlung profitiert.
Zu den Hindernissen für eine umfassende Implementierung gehört die Notwendigkeit eines multidisziplinären Sequenzierungstumors, um die komplexen Sequenzierungsergebnisse zu interpretieren, die notwendigen Computerressourcen zu verwalten sowie eine Methode für den Umgang mit zufälligen genetischen Entdeckungen, die durch die Sequenzierung entdeckt wurden, wie ein Risiko für Hämochromatose Der Körper absorbiert zu viel Eisen.

Es ist wichtig, eine vierwöchige Bearbeitungszeit für die Ergebnisse zu erreichen, da dies der Zeitraum ist, in dem Personen normalerweise warten müssen, bis erfolglose Behandlungen ihre Systeme verlassen, bevor sie eine klinische Studie beginnen.
Der leitende Forscher Dr. Arul Chinnaiyan, Direktor des MCTP, Howard Hughes Medical Institute Investigator und S. P. Hicks Professor für Pathologie an der U-M Medical School, sagt:

"Sobald einige der praktischen und technologischen Hürden ausgeräumt sind, stellen wir uns eine Reihe von Mutations- und Stoffwechselstudien für verfügbare zielgerichtete Therapien vor, die auf molekularer Einschätzung basieren. Wenn Patienten mit passenden zielgerichteten Therapien behandelt werden und Sekundärresistenzen entwickeln, Es könnte auch helfen, die Mechanismen der Resistenz aufzudecken und zukünftige Studien für Kombinationstherapien zu informieren. "

Laut Chinnaiyan wurde die Arbeit nur durch Zusammenarbeit und Teamwork ermöglicht. Die U-M-Ärzte Dr. Moshe Talpaz, Dr. Stephen Gruber und Dr. Kenneth Pienta spielten eine wichtige Rolle bei der klinischen Umsetzung dieses Explorationsprotokolls.
Das Team hofft, dass diese Art der Sequenzierung in den nächsten 5 bis 10 Jahren weiter verbreitet wird. Krebspatienten werden ermutigt, mit ihren Ärzten über klinische Studienmöglichkeiten zu sprechen.
Geschrieben von Grace Rattue